Theo Bộ Xây dựng, việc xác định công trình xây dựng thuộc đối tượng phải có giấy phép xây dựng hay miễn giấy phép xây dựng (không yêu cầu phải cấp phép xây dựng) căn cứ vào quy định pháp luật về xây dựng có hiệu lực đến thời điểm khởi công công trình.
Theo quy định của pháp luật về xây dựng qua các thời kỳ (từ năm 1998 đến nay) thì công trình thuộc dự án đã được Thủ tướng Chính phủ quyết định đầu tư đều thuộc đối tượng được miễn giấy phép xây dựng (không yêu cầu phải cấp phép xây dựng).
Trước đó, HDTC có đơn phản ánh, ngày 16-11-1998 Thủ tướng Chính phủ đã ban hành Quyết định 1042/QĐ-TTg về dự án đầu tư cơ sở hạ tầng Khu đô thị An Phú- An Khánh (quận 2). Tiếp đến ngày 13-8-1999 Thủ tướng ban hành Quyết định số 783/QĐ-TTg về việc giao đất cho Công ty Phát triển kinh doanh nhà TPHCM để đầu tư hạ tầng cơ sở Khu đô thị An Phú- An Khánh (quy mô 131ha).
Tuy nhiên, trong quá trình thi công một số công trình tại khu đô thị này (khu E và khu D), chủ đầu tư đã bị UBND Quận 2 và UBND TPHCM xử phạt hành chính vì không có giấy phép xây dựng.
Theo Bộ Xây dựng, các công trình nêu trên thuộc khu đô thị, khu nhà ở đã có quy hoạch chi tiết xây dựng tỷ lệ 1/500 được cơ quan nhà nước phê duyệt trước năm 2006 thì thuộc đối tượng không yêu cầu phải có giấy phép xây dựng và nay tiếp tục xây dựng thì không phải đề nghị cấp phép xây dựng nhưng phải đảm bảo phù hợp với quy hoạch chi tiết 1/500, tuân thủ quy định của pháp luật về xây dựng và pháp luật liên quan.
Bộ Xây dựng đã đề nghị Sở Xây dựng TPHCM hướng dẫn HDTC thực hiện theo quy định của pháp luật, tham mưu đề xuất UBND TPHCM các giải pháp tháo gỡ khó khăn cho doanh nghiệp.
Cục Quản lý hoạt động xây dựng (Bộ Xây dựng) trước đây cũng đã đề nghị chủ đầu tư làm rõ, bổ sung và hoàn thiện hồ sơ cụ thể những nội dung sau:Theo nội dung của các văn bản pháp lý kèm theo hồ sơ trình thẩm định thiết kế cơ sở, Khu đô thị mới An Phú – An Khánh đang thực hiện điều chỉnh quy hoạch phân khu tỷ lệ 1/2000.
Do vậy, chủ đầu tư cần liên hệ với cơ quan quản lý về quy hoạch, kiến trúc tại địa phương để xác định hồ sơ trình thẩm định thực hiện theo các văn bản phê duyệt quy hoạch chi tiết tỷ lệ 1/500 nêu trong hồ sơ trình thẩm định còn phù hợp với quy hoạch phân khu và quy hoạch chung của khu vực.
Chủ đầu tư cần có báo cáo cụ thể về tình trạng triển khai thi công của Dự án ở thời điểm hiện tại. Đồng thời, liên hệ với cơ quan quản lý trật tự xây dựng tại địa phương để được hướng dẫn về các nội dung xây dựng chưa đúng quy định của pháp luật hiện hành (nếu có).